По состоянию на 31 декабря 2018 г. помимо ПАО «Магнит» в Группу входят следующие общества: ООО «Ритейл импорт», развивающее оптовую торговлю алкогольной продукцией, ООО «Сельта», оказывающее транспортные услуги Группе; ООО «Тандем», ООО «Алкотрейдинг», ООО «БестТорг», ООО «МФК» (прежние наименования ООО «Тандер-Магнит»); ООО «Тепличный комплекс «Зелёная линия» (прежние наименования – ООО «Проект-М», ООО «Тандер-Петербург»), ООО «Звезда», ООО «Логистика Альтернатива», ООО «МагнитЭнерго», ООО «ТД-холдинг», ООО «ИТМ», ООО «Управляющая компания «Индустриальный парк Краснодар», ООО «Кондитер Кубани», ООО «Кубанский комбинат хлебопродуктов», ООО «Волшебная свежесть», ООО «Морозные припасы», ООО «Москва на Дону», ООО «Магнит Фарма» (прежнее наименование ООО «Фармасистемс»), ООО «МФ-СИА» и его дочерние общества.